小麦苗期施肥要施足底肥，补施种肥，才能保证苗期生长对养分的需要。
       一、施足底肥。施足底肥是提高麦田土壤肥力的重要措施，能促进早生快发，使麦苗在冬前长出足够的健壮分蘖和强大的根系，并为春后生长打下基础。底肥对小麦中期稳长、成穗和防止后期早衰也有良好作用。底肥的数量，应根据产量要求，肥料种类、性质、土壤和气候条件而定。底肥应占施肥总量的60%-70%为宜。应以有机肥料为主，适量配合施用氮、磷、钾等化学肥料。小麦底肥特点是高磷低钾，因此对一般肥力的地块应选用通用型复混肥，对较高肥力的地块应选用低氮高磷型复混肥。一般亩施农家肥1000～1500公斤，尿素10公斤或碳铵25公斤，高浓度复混肥25～30公斤。也可据此原则，配施尿素（或碳铵）、二铵（或过磷酸钙）和钾肥。除非干旱无法追肥外，底、追肥一般是分开进行的，切不可图省工、怕费事，进行底、追肥一次性施肥了事。
      二、补施种肥。种肥适宜的养分配比要以磷为主，配施少量的氮。肥料品种可选复合肥或单质肥。在长江中下游麦区，最常用的种肥品种是低浓度的过磷酸钙和适量硫酸铵为宜。由于种肥适宜的养分配比是磷多氮少，通常不要选用高氮复合肥作种肥，以免引起苗不旺或烧苗问题。所以尿素、碳酸氢铵和氯化铵等都是不宜做种肥的。
      种肥的施用量掌握少而精的原则，磷酸二铵以5公斤/亩为宜，虽然它的数量不多，但可以起到“四两拨千斤”的作用；过磷酸钙以8公斤/亩为宜；硫酸铵不要超过5公斤/亩为宜。在种肥施用过程中，施肥方法和位置同样很重要，无论采用机播方式还是畜播方式，种肥都不能直接与麦种接触，要将化肥施在麦种的斜下方2～3公分处，使麦种与常规化肥隔开才安全。
      从播种到返青这阶段，正逢冬春两季的低温和干旱气候。当幼苗刚出来时，根系发育较弱，吸收肥水的能力也差，而小麦苗期对于营养的需求数量虽然不多，但很敏感与严格，需要供应少而精的营养。此时补施种肥可以提高麦苗抗旱抗寒能力，保证小麦安全越冬和顺利返青，达到培育壮苗的目的。
      麦苗对磷肥的需要十分迫切，对于磷肥的反应敏感，苗期又是磷素营养的临界期，此时如果供磷不足或严重缺磷，就会出现苗弱和苗不齐。因此种肥最需要的是磷肥。而过了苗期，以后即使再补施磷肥也不能弥补前期所造成的损失。有人认为，基肥中已经施了磷，为什么种肥还强调施磷肥呢？因为基肥中磷施得深，而麦苗根系较浅，由于空间的错位而使麦苗吸收不到；同时与磷的特点相关，它在土壤中的移动性比氮和钾都差，空间有效性低，所以磷肥要分层施用。除了深层施磷基肥以外，还要通过种肥施用速效性磷肥，才可弥补这一缺陷；另外，磷对促进根系发育有明显的作用，可达到提高其它养分吸收的作用。